04/07/2026
Quy Trình Nhập Khẩu Nông Sản Vào Việt Nam Mới Nhất (Theo Thông tư 01/2024/TT-BNNPTNT)
❓ Nhập khẩu nông sản cần thực hiện những thủ tục gì?
Nông sản là nhóm hàng thuộc diện quản lý chuyên ngành của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn. Vì vậy, ngoài thủ tục hải quan thông thường, doanh nghiệp còn phải thực hiện đăng ký kiểm dịch thực vật, kiểm tra an toàn thực phẩm (đối với hàng thuộc diện quản lý) và lấy mẫu kiểm dịch trước khi được thông quan.
⚠️ Chỉ cần sai sót một thông tin nhỏ trên chứng từ hoặc khai báo không chính xác trên hệ thống, doanh nghiệp có thể phải sửa hồ sơ nhiều lần, kéo dài thời gian thông quan, phát sinh chi phí lưu container, lưu bãi và ảnh hưởng đến kế hoạch giao nhận hàng hóa.
Dưới đây là quy trình nhập khẩu nông sản đang được áp dụng theo Thông tư 01/2024/TT-BNNPTNT mà doanh nghiệp cần nắm rõ.
📄 Bước 1: Kiểm tra và đối chiếu bộ chứng từ nhập khẩu
Ngay khi nhận được bộ chứng từ từ nhà xuất khẩu, doanh nghiệp cần kiểm tra đầy đủ và đối chiếu tính thống nhất giữa các chứng từ trước khi tiến hành đăng ký kiểm dịch.
Thông thường, bộ hồ sơ nhập khẩu sẽ bao gồm:
- Commercial Invoice (Hóa đơn thương mại)
- Packing List (Phiếu đóng gói)
- Bill of Lading (Vận đơn)
- Certificate of Origin (C/O – nếu có)
- Phytosanitary Certificate (Giấy chứng nhận kiểm dịch thực vật bản gốc)
Ngoài việc kiểm tra đủ chứng từ, cần đặc biệt lưu ý các thông tin phải khớp nhau giữa tất cả các giấy tờ như: Tên hàng hóa, tên khoa học (nếu có), số lượng kiện, trọng lượng, quốc gia xuất khẩu, số container, số seal, cảng đi và cảng đến.
Đây là bước rất quan trọng bởi mọi thông tin sẽ được sử dụng để khai báo trên hệ thống PQS và Cổng Thông tin Một cửa Quốc gia.
💻 Bước 2: Đăng ký kiểm dịch thực vật và an toàn thực phẩm
Sau khi kiểm tra bộ chứng từ, doanh nghiệp tiến hành đăng ký kiểm dịch thực vật trên phần mềm PQS.
2.1 Tạo tài khoản PQS
Tải phần mềm PQS trên trang web của chi cục kiểm dịch thực vật vùng II: [https://www.kdtv2.com/pmpqs](https://www.kdtv2.com/pmpqs)
Cơ quan quản lý sẽ cấp tài khoản trong khoảng nửa ngày làm việc.
2.2 Tạo hồ sơ đăng ký
Đăng nhập vào hệ thống ➡️ Chọn Nhập Khẩu ➡️ Đăng ký Kiểm dịch thực vật/ATTP ➡️ Chọn Mở đăng ký ➡️ Tạo hồ sơ.
Doanh nghiệp cần nhập đầy đủ các thông tin theo bộ chứng từ, bao gồm:
- Thông tin doanh nghiệp & Người nhập khẩu
- Thông tin lô hàng (Quốc gia xuất khẩu, Cửa khẩu nhập)
- Phương tiện vận chuyển (Số vận đơn, Thông tin container)
- Thông tin kiểm dịch
Tiếp theo, chọn Thêm hàng hóa để khai báo chi tiết (Tên hàng, Tên khoa học, Mã HS, Nguồn gốc, Số lượng/Khối lượng...). Lưu ý: Kiểm tra lại toàn bộ thông tin một lần nữa trước khi gửi hồ sơ.
2.3 Gửi hồ sơ
Cần thực hiện lần lượt 3 thao tác:
- Tạo hồ sơ Cổng thông tin Một cửa Quốc gia.
- Gửi hồ sơ Cổng thông tin Một cửa Quốc gia.
- Gửi hồ sơ trên phần mềm PQS.
📌 Lưu ý: Doanh nghiệp phải hoàn thành đầy đủ cả hai bước gửi hồ sơ trên PQS và Cổng Một cửa thì hồ sơ mới được tiếp nhận. Tiến hành đính kèm bản scan Phytosanitary Certificate và Packing List. Thời gian tiếp nhận hồ sơ khoảng 01 ngày làm việc.
🏢 Bước 3: Nộp hồ sơ tại Chi cục Kiểm dịch
Sau khi hồ sơ được tiếp nhận trên hệ thống, doanh nghiệp cần chuẩn bị:
- Phiếu đăng ký kiểm dịch (In từ hệ thống PQS).
- Packing List.
- Bản gốc Phytosanitary Certificate.
Mang toàn bộ hồ sơ đến Chi cục Kiểm dịch thực vật để đóng phí và hoàn tất thủ tục tiếp nhận.
🏛️ Bước 4: Thực hiện thủ tục hải quan
Khi đã có số đăng ký kiểm dịch, doanh nghiệp tiến hành khai báo tờ khai hải quan trên hệ thống VNACCS.
Sau khi mở tờ khai, cần liên hệ Hải quan để đăng ký chỉ thị lấy mẫu kiểm dịch trên hệ thống V5.
In tờ khai có chỉ thị.
Mang xuống cảng.
Xin xác nhận của Hải quan giám sát.
✂️ Bước 5: Cắt seal container và lấy mẫu kiểm dịch
Sau khi hoàn tất thủ tục với Hải quan, đổi phiếu cắt seal tại cảng. Hồ sơ gồm: Tờ khai có chỉ thị, Phiếu đăng ký kiểm dịch, Phiếu cắt seal, Bill of Lading.
Thuê công nhân cảng mở container và liên hệ cán bộ kiểm dịch để lấy mẫu. Sau khi lấy mẫu xong, cần:
- Ký xác nhận giấy giao mẫu.
- Đóng lại container & Bấm seal mới.
📸 Chụp hình: Quá trình lấy mẫu, container, số seal mới, cùi seal cũ (Lưu toàn bộ hình ảnh để làm hồ sơ và gửi khách hàng).
Cuối cùng, mang Biên bản lấy mẫu, CCCD, Giấy giới thiệu và cùi seal cũ đến Hải quan giám sát để xác nhận hoàn tất việc lấy mẫu.
✅ Bước 6: Nhận kết quả kiểm dịch và hoàn tất thông quan
Khi cơ quan kiểm dịch có kết quả đạt yêu cầu:
- Upload kết quả kiểm dịch lên hệ thống V5.
- Đính kèm biên bản chứng nhận.
- Thông báo Hải quan hoàn tất hồ sơ chuyên ngành.
- Sau khi Hải quan chấp nhận, doanh nghiệp hoàn tất thông quan và kéo hàng khỏi cảng.
💡 Những lưu ý quan trọng khi nhập khẩu nông sản
🔹 Luôn đối chiếu thông tin giữa chứng từ và hàng hóa thực tế.
🔹 Phytosanitary Certificate phải là bản gốc và còn hiệu lực.
🔹 Tên hàng trên Invoice, Packing List, Bill of Lading và Giấy kiểm dịch phải thống nhất.
🔹 Đảm bảo hàng hóa được dán nhãn đúng quy định trước khi lưu thông.
🔹 Theo dõi thường xuyên tình trạng xử lý hồ sơ trên PQS để kịp thời bổ sung.
🎯 Kết luận
Thủ tục nhập khẩu nông sản đòi hỏi doanh nghiệp phải thực hiện đồng thời nhiều bước chuyên ngành. Việc chuẩn bị hồ sơ chuẩn xác và phối hợp chặt chẽ với cơ quan Hải quan, Kiểm dịch sẽ giúp quá trình thông quan nhanh chóng, hạn chế tối đa chi phí phát sinh.
